Cara Install snakemake di Ubuntu 20.04

Pengenalan

Di tutorial ini kita akan belajar melakukan instalasi snakemake di Ubuntu 20.04

Update Database apt

Sebelum kita melakukan instalasi paket snakemake kita akan melakukan update database apt di komputer kita.

Kita bisa melakukan update database apt dengan menggunakan perintah apt-get berikut:

sudo apt-get update

Perintah alternatif untuk update database apt menggunakan perintah apt:

sudo apt update

Alternatif terakhir menggunakan perintah aptitude untuk mengupdate database apt:

sudo aptitude update

Cara Install snakemake di Ubuntu 20.04

Setelah database apt di komputer kita terupdate, kita bisa melakukan instalasi paket snakemake.

Ada tiga metode instalasi snakemake yang bisa anda gunakan yaitu menggunakan apt-get, apt dan aptitude.

Install snakemake Menggunakan apt-get

sudo apt-get -y install snakemake

Install snakemake Menggunakan apt

sudo apt -y install snakemake

Install snakemake Menggunakan aptitude

sudo aptitude -y install snakemake

Cara Uninstall snakemake di Ubuntu 20.04

Untuk melakukan uninstall / menghapus hanya paket snakemake kita bisa menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get remove snakemake

Uninstall snakemake dan paket-paket dependesi

Untuk melakukan uninstall / menghapus paket snakemake dan paket-paket dependensi yang sudah tidak dibutuhkan Ubuntu kita bisa menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get autoremove snakemake

Menghapus Konfigurasi dan/atau data snakemake dari Ubuntu

Untuk menghapus konfigurasi dan/atau data berkaitan dengan snakemake dari Ubuntu kita bisa menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get purge snakemake

Menghapus konfigurasi dan/atau data dan seluruh dependensi paket snakemake

Untuk menghapus konfigurasi dan/atau data dan seluruh dependensi paket snakemake kita bisa menggunakan perintah berikut:

sudo apt-get autoremove --purge snakemake